Die Welt ist unter die Herrschaft der Shinra Electric Power Company gefallen, einem teuflischen Konzern, der die Lebenskraft des Planeten selbst in Form von Mako-Energie in Beschlag genommen hat. In der Megalopolis Midgar leistet eine Anti-Shinra-Organisation namens Avalanche Widerstand. Cloud Strife, ein ehemaliges Mitglied der Eliteeinheit SOLDAT und jetzt ein Söldner, hilft der Gruppe. Ihm ist nicht klar, welche epischen Konsequenzen ihn erwarten.

Die Geschichte dieses ersten, eigenständigen Spiels im FINAL FANTASY VII REMAKE-Projekt spannt sich bis zur Flucht der Gruppe aus Midgar und taucht tiefer ein in die Ereignisse in Midgar als das original FINAL FANTASY VII.

Mako ist die Lebensenergie des Planeten, die der Shinra-Konzern mit seinen Reaktoren gnadenlos ausbeutet. Die Widerstandsgruppe Avalanche möchte das verhindern und heuert den Ex-SOLDATEN Cloud Strife an, damit er sie bei einem Anschlag auf einen von Shinras Mako-Reaktoren unterstützt. Hoch oben auf der Platte über den Slums von Midgar entbrennt ein heftiger Konflikt.

Nach der Explosion des Reaktors flieht die Gruppe durch Sektor 8, der stark in Mitleidenschaft gezogen wurde. Cloud schlägt sich alleine durch und trifft inmitten der Flammen und Trümmer plötzlich auf einen tot geglaubten Feind.

Die Phantome seiner Vergangenheit führen Cloud zu einer jungen Frau. Sie schenkt ihm eine Blume und verspricht ihm ein Wiedersehen. Die Hüter des Schicksals haben die Weichen gestellt.

Die Rettung des darbenden Planeten beginnt auf ein Neues.